آیدین خانکشی پور در سال 1361 در رشت متولد شد. مدرک کارشناسی نقاشی را به سال 1384 از دانشگاه سیستان و بلوچستان دریافت کرد. در سال‌های 1386 و 1388 به‌ترتیب به اخذ مدرک کارشناسی ارشد در دو رشته‌ی نقاشی و تصویرگری از دانشگاه هنر تهران پرداخت.

نخستین نمایش فردی‌اش را به سال 1386 در گالری گلستان تهران برگزار کرد. از ابتدای دهه 1390 در زمینه کیوریتوری نیز تجاربی را پشت سر گذاشت. وی همچنین در زمینه‌ی تدریس طراحی، نقاشی و چاپ دستی فعالیت دارد.

آثار آیدین خانکشی پور معمولاً با تاش‌های نرم قلمو، محو کردن موضوع و هاشورهای پیش‌زمینه و پس‌زمینه پدید می‌آیند؛ این خصوصیات در سه مجموعه از آثار او یعنی «بیگانه»، «تام تموزه» و «آزادی» قابل رویت هستند.